Народная украинская академия, являясь с 1997 года экспериментальной площадкой Министерства образования и науки Украины и автором-учредителем регионального экспериментального комплекса по отработке нового образовательного модуля, все направления своей деятельности подчиняет реализации научно-исследовательского проекта по становлению и развитию учебного заведения нового типа, представляющего собой инновационную модель непрерывного образования.
Основными приоритетами по НИР в НУА являются:

  • реализация эксперимента по отработке нового образовательного модуля;
  • развитие научных школ;
  • работа аспирантуры и докторантуры как источника подготовки и повышения квалификации научно-педагогических кадров;
  • публикация результатов научных исследований по комплексной тематике;
  • деятельность Студенческого научного общества и Ассоциации молодых ученых.

Научным коллективом НУА выполняется долгосрочная комплексная тема: «Интеллектуальный потенциал общества в условиях перманентных социальных изменений: пути сохранения и развития» (ГР№0117U005126). Научно-исследовательская работа НУА осуществляется в соответствии с Перспективным планом НИР до 2035 года в рамках научной школы под руководством проф. Астаховой Е. В. и предусматривает разработку единой научной проблемы. В выполнении научных исследований по теме принимают участие преподаватели всех кафедр НУА, сотрудники научных лабораторий, педагоги Специализированной экономико-правовой школы. Выполнение комплексных научных исследований в НУА осуществляется в различных формах: регулярно проводятся научные конференции и семинары, в том числе и международного уровня, развивается аспирантура и докторантура, ежегодно издается научный сборник статей «Ученые записки ХГУ «НУА», на кафедрах академии работают научные кружки. Студенты НУА являются призёрами многих городских, региональных, всеукраинских и международных конкурсов и олимпиад. За период своего существования НУА успела создать собственные научные школы.